自闭症是一种基因类的遗传疾病。有研究证明，自闭症出现遗传可能是胚胎在形成过程中基因发生了突变导致的。特别是父亲的基因突变，对神经发育起着决定性作用。父亲的年龄越大，其孩子患自闭症的比率也会越来越来高。
自闭症并不是因为如家长忙没有时间陪伴，或者缺少玩伴等外在因素导致的，其实是自闭小孩本身带有病理基因，也就是先天性的。自闭症属于一种症候群，源于胎儿期，原因有很多种，目前的研究结果比较倾向于遗传物质病变，与基因突变有关，即胎儿还在肚子里的时候，胚胎形成过程中基因发生突变。还有一些研究认为与重金属超标有关系，自闭症与汞中毒的症状有一些相似的地方。
自闭症是可能会遗传给下一代的。目前从遗传学上的研究发现自闭症的遗传率达到了80%，也就是说从病因上来说，遗传的可能性是很大的。但是并不是说所有的自闭症患者，其后代一定会是自闭症。只是从概率上来说，会比普通人群中的下一代会更容易患有自闭症。
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