卵黄囊的结构为椭圆形
卵黄囊的正常形态是椭圆形或者是圆形，在怀孕第4周，卵黄囊囊壁就会形成3层细胞结构：最外层为外胚层的扁平细胞层，最内层是内胚层上皮细胞，两层之间是中胚层，其内原始毛细血管网内包含血岛和造血干细胞。
从第5周开始，卵黄囊囊壁可清晰分辨出2个腔室：中胚层腔和内胚层腔，前者由血管和间叶组织构成，后者则由内胚层上皮细胞和内胚层囊泡或囊管组成，胚内和胚外血管均包含有原始有核幼红细胞和早幼红细胞。
当孕囊平均直径在5-6mm时，通过阴道超声就可发现卵黄囊，正常来说，卵黄囊中央无回声，周边厚薄一致，边界清晰的环形高回声，具体如下图：
孕囊直径在5-6mm时可通过超声发现卵黄囊
A图白色箭头显示妊娠囊内的正常卵黄囊，黑色箭头表示胚胎，在其中还可见羊膜、羊膜囊、绒毛膜囊和卵黄管等组织，B图为经阴道超声显示妊娠第9周的存活胚胎以及卵黄囊。
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